專書

1. 《景印解說‧高郵王氏父子手稿》（臺北：中央研究院歷史語言研究所‧珍藏史料暨典籍系列之二，2000）。
2. 《書寫讀誦》（臺北：紹農山莊，2006）。
3. 《當甲骨遇上考古----導覽YH127坑》（臺北：中央研究院歷史語言研究所‧文物陳列館叢書1，2006出版，2008第二刷）。
4. 李宗焜著，高田真菊譯，《甲骨学史の奇跡：殷墟YH127坑の發掘と出土甲骨》（京都：藝文書院，2008）。
5. 李宗焜整理，《文苑英華》（臺北：中央研究院歷史語言研究所‧慶祝史語所八十周年，2008）。
6. 中央研究院歷史語言研究所編，《史語所購藏甲骨集》（臺北：中央研究院歷史語言研究所‧珍藏史料暨典籍系列之四，2009）。
7. 李宗焜主編，《古文字與古代史》第二輯（臺北：中央研究院歷史語言研究所‧會議論文集之九，2009）。

學位論文

1. 甲骨文字釋林研究（臺灣大學中文研究所碩士論文，1990）。
2. 殷墟甲骨文字表（北京大學古文獻研究所博士論文，1995）。
   

論文

1. 〈卜辭所見一日內時稱考〉，《中國文字》新18（1994），頁173-208。
2. 〈論殷墟甲骨文的否定詞「妹」〉，《歷史語言研究所集刊》66，4（1995.12），頁1129-1147。
3. 〈《殷墟甲骨刻辭類纂》刪正〉，《大陸雜誌》94，6（1997.6），頁241-260。
4. 〈釋磬聲〉，《第三屆國際中國古文字學研討會論文集》（香港：香港中文大學中文系1997.10），頁205-210。
5. 〈商代的占卜活動〉，《歷史月刊》126（1998.7），頁37-43。
6. 〈從分期分類談甲骨書法風格〉，《「出土文物與書法」學術討論會論文集》（臺北：文建會、中華書道學會，1998.10），頁1-20。
7. 〈記王念孫、王引之父子手稿(上) 〉，《古今論衡》1（1998.10），頁98-108。
8. 〈記王念孫、王引之父子手稿(下) 〉，《古今論衡》2（1999.6），頁123-132。
9. 〈《甲骨文字編》芻議〉，《甲骨文發現一百周年學術研討會論文集》（臺北：文史哲出版社，1999.8），頁111-127。
10. 〈介紹甲骨文〉，《國文天地》172（1999.9），頁37-40。
11. 〈殷墟發掘的甲骨〉，《古今論衡》4（2000.6），頁2-14。
12. 〈從甲骨文看商代的疾病與醫療〉，《歷史語言研究所集刊》72，2（2001.6），頁339-391。
13. 〈李陽冰篆學探原〉，《歷史語言研究所集刊》73，4（2002），頁827-855。
14. 〈「《殷墟甲骨刻辭》刪正」補說〉，《龍宇純先生七秩晉五壽慶論文集》（臺北：台灣學生書局，2002），頁209-238。
15. 〈論甲骨殘斷文字〉，《中國文字》新29（2003）。
16. 〈傅圖收藏的「項子京舊藏」古籍〉，《古今論衡》10（2003.12），頁25-38。
17. 〈龍宇純先生六書形聲說〉，《先秦兩漢學術》3（2004.6），頁171-184。
18. 〈劉體智與容庚往來函札〉，《古今論衡》13（2005.11），頁3-36。
19. 〈數字卦與陰陽爻〉，《史語所集刊》77，2（2006.6），頁279-318。
20. 〈陶拍與卦序〉，《中國文字》新31（2006.11），頁37-44。
21. 〈卜辭中的「望乘」—兼釋「比」的辭意〉，《古文字與古代史》第一輯（臺北：中央研究院歷史語言研究所，2007），頁117-138。
22. 〈宋本《文苑英華》殘頁〉，《古今論衡》17（2007.12），頁53-63。
23. 〈甲骨文的發現與寧文之辨發覆--以王懿榮與陳介祺往來函札為例〉，《古今論衡》18（2008.12），頁33-46。
24. 〈留與後人做掌故—臺靜農教授書法二三事〉，《中華文物學會》2009慶祝學會三十週年特刊（2009.03），頁82-93。
25. 〈卜辭「爯冊」與《尚書》之「誥」〉，《史語所集刊》80.3（2009.09），頁333-354。
26. 〈甲骨文的發現與寧文之辨發覆—以王懿榮與陳介祺往來函札為例〉，《古今論衡》18（2008.10），頁33-46。
27. 〈宋本《文苑英華》殘頁〉，《古今論衡》17（2007.12）頁53-63。
28. 〈宋本《文苑英華》導論論文〉，《文苑英華》（臺北：中央研究院歷史語言研究所，2008），頁1-14。
29. 〈花東卜辭的病與死〉，《從醫療看中國史》（臺北：聯經出版公司，2008），頁15-28。
30. 〈沚戛的軍事活動與敵我關係〉，《古文字與古代史》第二輯（臺北：中央研究院歷史語言研究所，2009），頁71-91。
31. 〈王念孫批校本《呂氏春秋》後案〉，《出土文獻與傳世典籍的詮釋——紀念譚樸森先生逝世兩周年國際學術研討會論文集》（上海：上海古籍出版社，2010.10），頁495-503。
32. 〈甲骨之「最」在史語所〉，《文化資產保存學刊》14（2010.12），頁89-90。
33. 〈甲骨文字分合與字形研究舉隅〉，《國科會中文學門小學類92-97研究成果發表會論文集》（臺北：台灣師大國文系出版，2011.4），頁47-53。
    

會議論文

1. 〈李陽冰篆書探原〉，「第一屆古文字與出土文獻學術研討會」，史語所，2000.11.16-17。
2. 〈先秦占卜管窺：周原甲骨的數字卦及其他〉，發表於「占卜與醫療學術研討會」，史語所，2003.8.29。
3. 〈留與後人做掌故—臺靜農教授書法二三事〉，「慶祝靜宜大學創校50週年國際書畫藝文研討會」，2006.12.2-3。
4. 〈《類纂》刪正補遺〉，《第27次中國學國際學術大會會議論文集》（韓國中國學會，2008），頁89-105。
5. 〈甲骨字形學—以甲骨文字分合為中心的討論〉，「紀念殷墟發掘八十週年學術研討會」，史語所，2008.10.13-10.14。
6. 〈殷墟發掘文物的數位化與學術應用〉，「第六屆（2008）兩岸三院資訊技術交流與資源共享研討會」，中國張家界，2008.10.20-10.24。
7. 〈牛運震《論語注》與《論語隨筆》初探〉，「古道照顏色——先秦兩漢古籍國際學術研討會」，香港中文大學，2009.1.16-18。
8. 〈王念孫批校本《呂氏春秋》後案〉，「出土文獻與傳世典籍的詮釋——紀念譚樸森先生逝世兩周年國際學術研討會」，復旦大學出土文獻與古文字研究中心，2009.6.13-14。
9. 〈數位資料的加值應用—以史語所開發科普動畫為例〉，「第七屆（2009）兩岸三院資訊技術交流與資源共享研討會」，中國雲南麗江，2009.9.14-18。
10. 〈甲骨文與文化記憶〉，「博物館電腦網路協會台灣分會2010年會」，博物館電腦網路協會台灣分會與數位典藏與學習之海外推展暨國際合作計畫聯合舉辦，2010.3.02-04。
11. 〈甲骨文字分合與字形研究〉，「國科會中文學門小學類92-97研究成果發表會」，國立臺灣師範大學國文學系，2010.3.20。
12. 〈甲骨字形的研究──兼談甲骨字形的美學意義〉，中研院、國家文化總會主辦「甲骨文與文化記憶世界論壇」，史語所，2010.8.28-29。
13. 〈婦好在武丁王朝的角色〉，「第三屆古文字與古代史國際學術研討會」論文，史語所，2011.3.25-27。