自從上帝摧毀巴別塔（Babel）之後，溝通就一直是人類的問題。因此西方傳教士重譯來華，只為傳播上帝的福音；而我則逡巡於各地的圖書館，找尋十七、八世紀中西文化接觸失落的踪跡。

評價文化接觸的經驗不是我關心所在；恰如我一點也不關心中國接納西方科技的成敗。我只著重歷史主體如何將他們在文化接觸中所獲得的知識、技術藉由具體的行動，表達他們所知所信，從而塑造了知識、技術和自身存在的意義。因此，我討論「科學史的史學史」，以理解十七、八世紀的行動者如何透過書寫自然知識的歷史，重構西學與中國傳統自然知識間的關係。我分析歷史行動者在面對異文化時，如何挪用不同的文化資源，融合不同的文化因子，創造自我的敘事，肯定自身的存在意義。我探討新物質的創造與引進，以理解物品如何直接影響人們的互動與生活；討論人群互動如何銘刻在物品上，使物品成為見證人群互動的遺跡。

也許這種看來純知識的追求是無能寫出有效歷史（effective history）的託辭；但也許描繪歷史的殊異性，會成為批評當代文化的鏡子，從歷史細節顛覆現代人自身的存在。

未來的計畫乃現在想法的實踐。我手上打算著三本書：（一）《十七、八世紀中國的曆算學》，探討歷史行動者如何在中國的權力場域中，一步步轉化西學的內容與意義，使之符合中國的文化狀態，進而將西方曆算學納入中國的曆算傳統。（二）《明清之際的天主教醫學》，考察明清之際藉由天主教所傳入的醫學知識如何深植於當時中西雙方的宗教與政治脈絡中，以明用現代科學的觀點，無以全然理解中國和西方有關自然的知識史。（三）《符象天堂》，以馬若瑟（Joseph de Prémare, 1666-1736）的中文文獻為中心，探討他如何以「符象論」（Figurism）的立場利用中國典籍處理文字起源、詮經學與禮儀之爭等問題。

歷史學者有著西齊弗斯（Sisyphus）的宿命，既無能一窺歷史全貌，只有孤獨地從文獻中重砌巴別塔，以徒勞紀念自己的生與死。

學位論文

1. “Technical Knowledge, Cultural Practices and Social Boundaries: Wan-nan Scholars and the Recasting of Jesuit Astronomy, 1600-1800” (PhD diss., UCLA, 1994).

專書

1. 《漢代的相人術》（臺北：學生書局，1990）。
2. 《說地：中國人習知大地形狀的故事》（臺北：三民書局，2003）。

論文

1. 〈從《肇論》、《壇經》論大乘空宗／禪宗的神祕主義──兼評道默林對大乘／禪宗的構想〉，《鵝湖月刊》166 (1989)：31-36。
2. 〈美國女性史研究動向簡介〉，《近代中國婦女史研究》2 (1994)：291-95。
3. 〈身體、靈魂與天主：明末清初西學中的人體知識〉，《新史學》7.2 (1996)：47-98。
4. “Ch’eng-Chu Orthodoxy, Evidential Studies and Correlative Cosmology: Chiang Yung and Western Astronomy,” Philosophy and the History of Science - A Taiwanese Journal 4.2 (1997): 71-108.
5. “Scientific Dispute in the Imperial Court: The 1664 Calendar Case,” Chinese Science (UCLA) 14 (1997): 7-34.
6. 〈跨文化知識傳播的個案研究：明清之際地圓說的爭議，1600-1800〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》69.3 (1998)：589-670。
7. 〈三角函數表與明末的中西曆法之爭──科學的物質文化試探〉（上）、（下），《大陸雜誌》99.5 (1999)：41-48；99.6 (1999)：9-18。
8. 〈通貫天學、醫學與儒學：王宏翰與明清之際中西醫學的交會〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》70.1 (1999)：165-201。
9. 〈展望臺灣的科技與醫療史研究：一個臺灣當代知識社群的分析〉，《中央研究院臺灣史研究所集刊》4.2 (1999)：157-174。
10. “Western Astronomy and Evidential Study: Tai Chen on Astronomy,” in Current Perspectives in the History of Science in East Asia, ed. Yung Sik Kim and Francesca Bray (Seoul: Seoul National University Press, 1999), pp. 131-144.
11. “Trust, Instruments, and Cross-Cultural Scienctific Exchanges: Chinese Debate over the Shape of the Earth, 1600-1800,” Science in Context 12.3 (1999): 385-411.
12. 〈「琉球」：一個不「小」的漁村〉，《古今論衡》5 (2000)：104-111。
13. “Remembering Our Grand Tradition: The Historical Memory of the Scientific Exchanges Between China and Europe , 1600-1800,” History of Science 41.2 (2003): 193-215.
14. 〈金石盟──〈御製天主堂碑記〉與清初的天主教〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》75.2 (2004)：389-420。
15. 〈伏讀聖裁：《曆學疑問補》與〈三角形推算法論〉〉，《新史學》16.1 (2005)：51-84。
16. 〈宋、明之際的醫史與「儒醫」〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》77.3 (2006)：401-449。
17. 〈天學與歷史意識的變遷──王宏翰的《古今醫史》〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》77.4 (2006)：1-37。
18. “Archiving Knowledge: A Life History of the Chongzhen lishu (Calendrical Treatises of the Chongzhen Reign),” Extreme-Orient, Extreme-Occident Spring (2007): 159-184.
19. 〈經傳眾說：馬若瑟的中國經學史〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》78.3（2007），頁435-472。

書評

1. 〈簡介Morris J. Vogel, The Invention of the Modern Hospital, Boston 1870-1903〉，《新史學》6.2 (1995)：223-230。
2. 〈評介Thomas Laqueur, Making Sex〉，《新史學》7.4 (1996)：223-231。
3. 〈Shigehisa Kuriyama（栗山茂久）, The Expressiveness of the Body and the Divergence of Greek and Chinese Medicine讀後〉，《新史學》10.4 (1999)：145-158。
4. 〈評介韓琦，《中國科學技術的西傳及其影響》〉，《漢學研究》18.2 (2000)：427-431。
5. “Review of Science in Ancient China: Researches and Reflections (Aldershot, Great Britain: Variorum, 1995) and Medicine, Philosophy and Religion in Ancient China: Researches and Reflections (Aldershot, Great Britain: Variorum, 1996), by Nathan Sivin,” TheJournal of Asian Studies 60.2 (2001): 538-540.
6. 〈簡介Albert Chan, S. J., Chinese Books and Documents in the Jesuit Archives in Rome: A Descriptive Catalogue (New York & London: M. E. Sharpe, 2002)〉，《中國文哲研究所集刊》21 (2002)：455-457。
7. 〈評介Fa-ti Fan, British Naturalists in Qing China: Science, Empire and Cultural Encounter (Cambridge: Harvard University Press, 2004)〉，《新史學》16.3 (2005)：181-186。
8. 〈讀：黃一農《兩頭蛇：明末清初的第一代天主教徒》（新竹：清華大學，2005）〉，《新史學》170.2 (2006)：251-255。

會議論文

1. 〈身體與天主：《泰西人身說概》中的醫學與信仰〉，發表於「第四屆科學史」研討會，1996年。
2. “Western Astronomy and Evidential Study: Tai Chen on Astronomy” (conference paper for the 8th International Conference of Science, Technology and Medicine in East Asia, August, 1996).
3. 〈通貫天學、醫學與儒學：王宏翰與明清之際中西醫學的交會〉，發表於「醫療與中國社會」學術研討會，1997年。
4. “Debate over the Sphericity of the Earth in China, 1600-1800” (conference paper for the XXth Congress of the History of Science, July, 1997).
5. “Why Were All the Sages Freaks: Bizarre Physical Characteristics as a Discourse of Power” (conference paper for the 51st AAS, Boston, U.S.A., March, 1999).
6. 〈女體與廣告：臺灣塑身美容廣告史中的科學主義與女性美〉，發表於中央研究院歷史語言研究所主辦，「健與美」學術研討會，臺北：中央研究院歷史語言研究所，1999年6月。
7. “Shape My Body: The Representations of Feminity and Science in the Advertisements for Body Sculpturing Beauty Salons” (conference paper for the 9th International Conference of Science, Technology and Medicine in East Asia, August, 1999).
8. “The Last Crusade of the Chinese Astronomical Methods: A Preliminary Study of Dinliyuheng “ (conference paper for the Encounter and Dialogue, Ricci Institute, Beijing, October, 2001).
9. “Reminiscence: Chourenzhuan and the Scientific Exchanges between China and Europe, 1600-1800” (critical issues in the History of Science in Asia, MIT, November, 2001).
10. 〈臺灣戰後初期的漁業與國家，1945-1965〉，發表於中央研究院科學史委員會、清華大學科技與社會中心主辦，「第六屆科學史」研討會，2002年3月30-31日。
11. 〈反西法：《定曆玉衡》初探〉，收入卓新平主編，《相遇與對話：明末清初中西文化交流國際學術研討會文集》（北京：宗教文化出版社，2003），頁348-365。
12. “Medicine, Christianity and Confucianism: The Strange History of an Unlikely ‘Trinity’” (conference paper for the Perspectives of Chinese Antiquity International Conference, University Wurzburg, Germany, May 26-29, 2004).
13. “Struggle from the Periphery: ‘Nozoe Tetsuo and Japanese Colonial Science in Taiwan’” (paper presented at The 5th East Asian STS Conference: Science and Technology in Public Dispute, SeoulNationalUniversity, Seoul, Korea, December 8-11, 2004).
14. 〈明、清之際江南地區的醫病關係〉，發表於中央研究院歷史語言研究所主辦，「從醫療看中國史」國際研討會，臺北：中央研究院歷史語言研究所，2005年12月13-15日。
15. “Christianity, Natural Philosophy and History of Chinese Medicine: Wang Honghan and His Gujinyishi (Medical History Past and Present)” (International Workshop on the History of Science and Technology “Adoption and adaptation: the travel of methods, techniques and technologies between Asia and Europe and the transformations of know-how,” May 10-14, 2006).
16. “Taming the Western Sciences: Compiling Books and Writing Histories, 1600-1800” (CNRS, Paris, September 24-28, 2006).
17. “Problems with the Brain: European Anatomical Knowledge in Seventeenth-century China” (paper presented at The Kyujanggak International Workshop: Comparative Perspectives on the Introduction of Western Science into East Asian Countries during the Late Chosŏn Period, October 16-28, 2007).
18. 〈《崇禎曆書》的生命史與中西曆算之爭〉，發表於中國明代史研究會、東吳大學歷史學系、國立暨南國際大學歷史學系、國立臺灣師範大學文學院暨歷史學系聯合主辦，「全球化下明史研究之新視野」國際學術研討會，臺北/埔里：東吳大學/暨南國際大學，2007年10月27-31日。

編輯整理

1. 鐘鳴旦、杜鼎克、黃一農、祝平一等編，《徐家匯藏書樓明清天主教文獻》（臺北：方濟出版社，1996）。
2. 祝平一總編輯，鄭麗玲、許全義主編，《臺灣漁業史資料選編：統計篇（一）‧明治－大正II》（臺北：臺灣省漁業局，1998）。

翻譯

1. “The Evolution and Decline of the Ancient Chinese Practice of Watching for the Ethers,” Chinese Science 13 (1996): 82-105.

其他

1. 〈美國女性史研究動向簡介〉，《近代中國婦女史研究》2 (1994)：291-295。
2. 〈漢代相法略說〉，《歷史月刊》15 (1989)：30-31。
3. 〈實驗室中的隱形人：十七世紀英國的實驗助理〉，《歷史月刊》105 (1996)：116-119。
4. 〈雕給我一個身體：塑身美容廣告中的女性／主體〉，《婦女與兩性研究通訊》38 (1996)：9-17。
5. 〈說「猛男」〉，《婦女與兩性研究通訊》53 (1999)：7-8。
6. 〈碎鏡零史：戰後臺灣漁業史研究回顧〉，《新史學》12.2 (2001)：195-231。
7. “Le Prime Reazioni All’astronomia Occidentale,” in Storia della Scienza (Rome: Institvto della Enciclopedia Italiana, 2001), pp. 490-493.
8. 〈塑身美容、廣告與台灣九○年代的身體文化〉，收入盧建榮主編，《文化與權力──臺灣新文化史》（臺灣：麥田出版社，2001），頁259-296。
9. 〈西曆東漸：晚明中西曆法的初步接觸與曆法形式的衝突〉，《法國漢學‧第六輯（科技史專號）》（北京：中華書局，2002），頁336-344。